媽廟河位于澳頭中心區，流域上游有小（1）型水庫龍尾山水庫，集雨面積3.5km2；小（2）型水庫牛橋水庫。媽廟河自牛橋水庫溢洪道流經蘇苗墩、媽廟村、澳頭街道辦事處，在渡頭附近匯入淡澳河右岸（該段淡澳河為感潮河段）。媽廟河屬于住建部劃定的黑臭水體，2019年5月前完成了管網建設、生活污水截污和一定程度的河道清淤。